- 配合教育部資源投入 本校積極發展環境、毒理相關醫學研究，為強化資源利用效益，結合本校教學卓越計畫的深耕與永續經營之精神，為國家訓練專業毒理科學人才，以應對未來三十年毒理等因素對生活型態及生物基因交互作用下的健康威脅。
- 本學程擬以臨床毒理及基礎毒理為特色 台灣目前僅有台灣大學醫學院毒理學研究所、慈濟大學藥理暨毒理研究所等相關博碩士班存在。而本校於100學年度設立毒理學博士學位學程，結合本校毒理相關優異領域，以藥理/毒理/藥劑及臨床醫學為重點，從事跨領域研究，提升論文之質量，解決國人藥物食品與環境安全相關問題。此外本校附設醫院檢驗醫學部毒物室為南台灣醫學中心唯一通過食品藥物管理署濫用藥物尿液檢驗認證者，且與台北榮總毒物科同為台灣對性侵相關藥物專責鑑定單位，對臨床實務及待解決之問題更有切身感觸。本學位學程將藥學教育中之毒理/藥理/醫藥化學等專業研究與臨床醫學結合，對環境毒物、藥物安全、濫用藥物、臨床毒理學皆能深入探討。
- 本學程整合本校相關研究資源及附設醫院支持教學研究 本校藥學系及醫學研究所紮實之研究實力，配合本校頂尖研究中心發展，已有資源整合中心各項精密貴重儀器，且陸續設置分子影像系統實驗室、超微量分析實驗室及相關研究技術與資訊平台，更在頂尖研究中心發展計畫下成立國家級毒理學研究室，已購 置 兩 台 液 相 層 析 串 聯 質 譜 儀 (ABI 4000Q 及 2000Q 型 ) ， 感 應 耦 合 電 漿 質 譜 儀(ICP-MASS)，且已購置高解析度氣相層析質譜儀(HRGC/MS)及相關自動萃取儀、濃縮儀等，對頂尖研究助益良多。本校附設有醫學中心級之高雄醫學大學附設中和紀念醫院及區域教學級的小港醫院、大同醫院之醫療資源作為研究後盾，藉此可涵蓋毒理學與醫學結合之深度及廣度。
- 課程安排銜接完整，提高學生就讀意願 本校藥學系大學部開設有「毒理學」之基礎課程，博士班則設有毒理學博士學位學程。為銜接大學部至博士班之「環境醫學及毒理學」相關課程及學術研究，將成立本碩士學程整合醫學、藥學、化學、生命科學、公共衛生、生物資訊等教學資源，融入縱貫性學用合一課程模組設計理念，共同開設環境毒理學相關之核心訓練課程及實作學習，發展管理/臨床/科技/資訊毒理學之全方位課程模組，以培育具有足夠專業知能之健康研究及風險評估人才，以及具備臨床毒理基礎之醫療服務人員及產業研發人才。
- 產學合作 本校研究特色在醫藥生技相關領域，配合立法院通過之「生技新藥產業發展條例」，設有產學合作組及創新育成中心，積極推動教師參與產學合作，加強研發成果之技術移轉，提升學術附加價值及產業技術水準，而毒理學博士學位學程亦與國家環境衛生研究院環境毒物研究中心合作，建構標準化符合藥物非臨床試驗優良操作規範之基因毒性試驗中心，以期提供藥物非臨床前試驗所需之毒性試驗服務。
- 國際化(姊妹學校) 本校已和106所國外知名大學締結姊妹校及研究機構訂有交流協議，且持續建立合作關係。藥學院目前已與瑞典Uppsala大學及匈牙利Segzed大學簽訂雙聯學制，未來本學程學生可至姊妹校進修，以增強實力及國際觀。
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